国家高新技术企业认定需要二种审计报告，一种是企业年度财务审计报告，一种是专项审计报告，高新技术企业认定专项审计，是指经备案的中介机构鉴证的注册会计师接受申报企业委托，对其最近三个会计年度(实际经营不满三年的按实际经营年限)的研究开发费用结构明细表和最近一个会计年度的高新技术产品(服务)收入明细表进行审计，并出具专项审计报告。

报告有防伪标、有会计师营业执照、执业证书、及两个注册会计师证书。其中专审需要提供一份审计原件。

高新技术企业近三年应具备的研发投入比例如下：

（1）最近一年销售收入小于5,000万元的企业，比例不低于6%；

（2）最近一年销售收入在5,000万元至20,000万元的企业，比例不低于4%；

（3）最近一年销售收入在20,000万元以上的企业，比例不低于3%。

其中，企业在中国境内发生的研究开发费用总额占全部研究开发费用总额的比例不低于60%。企业注册成立时间不足三年的，按实际经营年限计算；

除了对研发投入比例要求外，高新技术企业还要求高新技术产品（服务）收入占企业当年总收入的60%以上。

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